《内经》阴阳的诊候、病性及禀赋体质表述
《内经》中阴阳的含义，涉及诊候、疾病性质、治则治法和禀赋体质等。阴阳是中医认识自然的基本方法，分析问题的基本逻辑语言，固化和上升经验的基本纲领，演绎中医防治方法的基本指导思想。诊候、疾病性质及治则治法阴阳
《素问·标本病传论》：“凡刺之方，必别阴阳，前后相应，逆从得施，标本相移。”此处阴阳指诊候和疾病性质。诊候、疾病性质同样有阴阳二分法的属性分类规律，但是，此处阴阳在诊候和疾病性质的认识和表述中具有特定含义，即阴阳既是质的区别，也有量的意义，是物质、信息变动的量度概念，如阴虚、阳虚等。阴阳是疾病量—质变化的反映。
诊候和疾病性质的阴阳多少、偏胜偏衰是由疾病的内在病机决定的，而病机又与病因、患者体质状况等密切相关，病因则既包括自然因素（生物、物理、化学等），也包括社会、心理因素。因此，辨析诊候、疾病性质的阴阳，需要对病因、体质等相关因素进行比类分析、揆度分析及综合分析。《素问·阴阳应象大论》：“治病必求于本”，本于阴阳就包括这个含义。
对于阴阳在诊候上的反映，《素问·阴阳应象大论》：“法阴阳奈何？……阳胜则身热，腠理闭，喘粗为之俛仰，汗不出而热，齿干以烦冤，腹满，死，能冬不能夏。阴胜则身寒，汗出，身常清，数栗而寒，寒则厥，厥则腹满，死，能夏不能冬。此阴阳更胜之变，病之形能也。”即阴阳是表现形式或趋势。
《素问·脉要精微论》：“阴阳不相应，病名曰关格。”《灵枢·脉度》：“阴气太盛，则阳气不能荣也，故曰关。阳气太盛，则阴气弗能荣也，故曰格。阴阳俱盛，不得相荣，故曰关格。关格者，不得尽期而死也。”关格是阴阳偏盛的疾病性质反映，或关于阴，或格于阳，或阴阳格拒不通，其证候表现不一样，阴阳量—质的关系也不一样。
《素问·评热病论》：“有温病者，汗出辄复热，而脉燥疾不为汗衰，狂言不能食，……病名阴阳交，交者死也。”阴阳交的病理也说明阴阳在疾病过程中量—质变动的特定规律，即阳热偏盛，阴精耗竭，阴液生化无源的病理规律。
因此，《素问·阴阳应象大论》：“（故）善诊者，察色按脉，先别阴阳；审清浊，而知部分；视喘息，听音声，而知所苦；观权衡规矩，而知病所主。按尺寸，观浮沉滑涩，而知病所生；以治无过，以诊则不失矣。”中医辨证诊断的目的就是要辨识疾病的阴阳量—质变动情况。
《灵枢·寿天刚柔》：“故曰病在阴之阴者，刺阴之荥输；病在阳之阳者，刺阳之合；病在阳之阴者，刺阴之经；病在阴之阳者，刺络脉。……病有形而不痛者，阳之类也；无形而痛者，阴之类也。无形而痛者，其阳完而阴伤之也，急治其阴，无攻其阳；有形而不痛者，其阴完而阳伤之也，急治其阳，无攻其阴。阴阳俱动，乍有形，乍无形，加以烦心，命曰阴胜其阳，此谓不表不里，其形不久。”由于阴阳表里疾病性质的不同，治疗也应采取不同原则。
《灵枢·终始》：“凡刺之道，毕于终始，明知终始，五藏为纪，阴阳定矣。阴者主藏，阳者主府，阳受气于四末，阴受气于五藏。故泻者迎之，补者随之，知迎知随，气可令和。和气之方，必通阴阳，五藏为阴，六府为阳。”调和阴阳是治疗疾病的基本思想。调和阴阳的方法包括疏通阴阳、扶抑阴阳，以及从阳引阴，从阴引阳等。
禀赋体质阴阳
《灵枢·通天》：“盖有太阴之人，少阴之人，太阳之人，少阳之人，阴阳和平之人。凡五人者，其态不同，其筋骨气血各不等。”本篇将阴阳多少用于人的体质分类，其中涉及人格特征、外貌、行为倾向等。《内经》认为这是由于人体禀赋阴阳的多少不同，因此，在形体、生理功能倾向等方面也有差别。
此外，《灵枢·阴阳二十五人》、《灵枢·本藏》、《灵枢·逆顺肥瘦》、《灵枢·卫气失常》、《灵枢·论勇》等篇也论及体质的划分与不同，这些分类法和不同体质的认识也反映出阴阳禀赋的多少及功能活动、疾病易感受性等的差异。
体质分阴阳是认识疾病性质阴阳的主要组成部分，是对人体禀赋阴阳多少的概括。体质阴阳包括体格、个性心理、疾病易感性等，此外也包括年龄差异、性别差异等表现在体格方面的不同，如认为小儿、妇女在体质阴阳上与成年男子不同，而通常的成年人之间，体质也因地域、职业、生活习惯等的不同而存在很多差异，这些差异是由于人体在遗传、繁衍过程中所禀受阴阳（包括先天阴阳和自然阴阳）的多少不同导致的。
《内经》对体质阴阳的认识是建立在天人相应的理论基础上，以人与自然协调统一，以及人类个体在遗传、生长发育、生活工作、社会活动等方面的特点与作用为影响因素（包括疾病因素）所形成的体格变化过程和系统。因此，《内经》所指的体质既有禀赋的含义（先天阴阳），也有人个体受地理、气候环境影响的不同生理、病理特点（后天阴阳），以及对某些疾病的易感、易患趋势，疾病预后的不同倾向等。
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