《内经》的属性分类
阴阳在中医理论中的广泛应用及概念、含义的丰富，应发端于《黄帝内经》，其涉及的主要篇章不下数十篇。《内经》对于阴阳的概念、含义，以及临床应用的意义等均作了深入阐发。其中包括了分类学的含义。用阴阳进行事物分类 在《内经》理论中阴阳首先是作为事物分类的两种不同属性，如天为阳，地为阴；日为阳，月为阴；火为阳，水为阴；动为阳，静为阴等。即阴阳是在有限系统中进行二分分类的方法，阴阳所代表的属性通常是相反的、相对的、相区别的。如《素问·金匮真言论》：“夫言人之阴阳，则外为阳，内为阴。言人身之阴阳，则背为阳，腹为阴。言人身之藏府中阴阳。则藏者为阴，府者为阳。肝心脾肺肾五藏，皆为阴。胆胃大肠小肠膀胱三焦六府，皆为阳。”“背为阳，阳中之阳，心也；背为阳，阳中之阴，肺也；腹为阴，阴中之阴，肾也；腹为阴，阴中之阳，肝也；腹为阴，阴中之至阴，脾也。此皆阴阳表里内外雌雄相俞应也，故以应天之阴阳也。”
阴阳是二分法，在特定系统中，事物要么属阴，要么属阳，或阳中之阳，阳中之阴，阴中之阳，阴中之阴，而不存在非阴非阳的第三类。也不可能在同一系统中事物皆属阳，或皆属阴，如以表里系统言，不可能表为阳，里也为阳。二分法是事物基本属性分类的特点，它表明同一系统中存在相反、相对和相异的事物属性。因此，《素问·阴阳应象大论》：“天地者，万物之上下也；阴阳者，血气之男女也；左右者，阴阳之道路也；水火者，阴阳之征兆也；阴阳者，万物之能始也。”以阴阳分类血气身形就像把自然分为天地上下一样，但阴阳本身具有运行规律和征象，阴阳是万物生长、变化和相互作用的基础，万物生化、作用可以用阴阳来演绎说明。
阴阳属性的划分是人为的，是对一般规律的高度抽象性概括，因此，阴阳又具有无限可分的性质。如《素问·阴阳离合论》：“阴阳者，数之可十，推之可百，数之可千，推之可万，万之大不可胜数，然其要一也。”根据《内经》的这一思想，那么现今对自然、社会、人体，以及基因，甚至对微粒子的分类似乎都同样可以适用阴阳二分法。即阴阳是符号，是分类方法，如《灵枢·阴阳系日月》：“此天地之阴阳也，非四时五行之以次行也。且夫阴阳者，有名而无形，故数之可十，离之可百，散之可千，推之可万，此之谓也。”
阴阳用于时间、生理、、病理、疗效等方面的分类
《内经》不但将阴阳分类的方法用于概括天地、人体脏腑内外，而且用于时间过程和生理、病理、治疗等方面的规范描述。如将阴阳用于时间过程的属性分类。如《素问·金匮真言论》：“阴中有阴，阳中有阳。平旦至日中，天之阳，阳中之阳也；日中至黄昏，天之阳，阳中之阴也；合夜至鸡鸣，天之阴，阴中之阴也；鸡鸣至平旦，天之阴，阴中之阳也。”这是依据日月运行（地球的自转）确定时间过程的阴阳属性。
阴阳用于人体生理、病理，以及疾病病因、病机等的归类，如《素问·阴阳应象大论》：“故积阳为天，积阴为地。阴静阳躁，阳生阴长，阳杀阴藏。阳化气，阴成形。寒极生热，热极生寒。寒气生浊，热气生清。清气在下，则生飧泄；浊气在上，则生*胀。此阴阳反作，病之逆从也。”本段从自然阴阳的属性、特征、生长收藏规律和作用，到人体阴阳的生化、消长，说明阴阳是生理的表现形式，逆阴阳则是病理的表现。在生理病理的阴阳认识中，《内经》更强调阴阳的相互依存和相互作用。
因此，《素问·阴阳应象大论》进一步提出，分辨阴阳属性的衡动、多少是中医治疗疾病的基本依据（治病求本）。《素问·阴阳应象大论》还指出“阴胜则阳病，阳胜则阴病。阳胜则热，阴胜则寒。重寒则热，重热则寒。”“阳胜则身热，……阴胜则身寒”等，说明疾病是阴阳属性偏离平衡状态的结果。因此，辨识阴阳是诊断、治疗疾病的根本，即《素问·阴阳应象大论》“治病必求于本”，本于阴阳的道理。
在治疗方面《素问·阴阳应象大论》指出“故善用针者，从阴引阳，从阳引阴，以右治左，以左治右，以我知彼，以表知里，以观过与不及之理，见微得过，用之不殆。”“因其轻而扬之，因其重而减之，因其衰而彰之。”《素问·至真要大论》：“治诸胜复，寒者热之，热者寒之……”等等，都是运用阴阳属性分类来指导治疗。
《素问·宝命全形论》：“人生有形，不离阴阳。”此处，既说明人身具有阴阳划分、属性分类的规律，同时本篇也强调“人以天地之气生，四时之法成”的自然阴阳思想。
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